Le mode de décision et d’organisation du mouvement est fondé sur la confiance et recherche le consensus. Animé d’un fort esprit familial, les relations sont simples et fraternelles avec une relation directe entre les niveaux de responsabilité. La pratique de la subsidiarité permet à chacun d’assumer ses responsabilités en s’adaptant aux contraintes locales, dans le respect du projet éducatif des SUF. Elle suppose la confiance et laisse toute sa part aux jeunes chefs.

La gestion financière du mouvement est conforme à son projet éducatif. Elle prône la simplicité des moyens et fait en sorte, par la solidarité, que les cotisations ne soient pas un obstacle pour les familles. Les moyens financiers sont exclusivement consacrés au projet éducatif. L’association est financée quasi-exclusivement par les cotisations, dons de ses membres et la vente de calendriers, gage de son autonomie. L’association ne reçoit pas de subvention publique nationale. Elle ne détient qu’un seul immeuble : la maison des SUF, siège de l’association et lieu dans lequel travaillent les salariés du Centre national.

Les SUF ont fait le choix d’une structure légère. Ils n’ont retenu que deux échelons : l’échelon local (le groupe) et l’échelon national (l’équipe nationale accompagnée par les commissaires généraux). Les délégués régionaux jouent un rôle de coordination entre l’équipe nationale et les chefs de groupe, ils ne sont pas un échelon supplémentaire. Par ailleurs, le nombre de salariés est volontairement peu élevé au regard de l’effectif des bénévoles qui œuvre pour l’association.

Les SUF sont un mouvement de bénévoles dont le mandat est limité dans le temps : 3 ans pour les chefs de groupe et les équipes nationales, 4 ans pour les délégués régionaux, 2 fois 2 ans pour les commissaires généraux. Chez les jeunes, les limites d’âge permettent d’encadrer la durée des missions. Cette limitation des mandats permet au bénévole de faire de son mieux pendant sa mission, qu’il transmettra à la fin de son mandat (ceci évite la logique d’appropriation).

L’ensemble des membres titulaires compose l’assemblée générale de l’association, notamment les chefs d’unité, leurs assistants, les guides-aînées et routiers y compris mineurs, les chefs de groupe et leurs assistants, les aumôniers et tous les membres des Instances nationales. 

Elle se réunit tous les ans lors des Journées nationales (JN), week-end scout au cours duquel a lieu un temps de scrutin, après la présentation des rapports moraux et financiers.